Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp48Q3V0C5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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