Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ttc9Q3V038 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ttc9Q3V038 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ttc9Q3V038 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ttc9Q3V038 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9Q3V038 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms