Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnpc3Q3UZ01 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms