Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chpf2Q3UU43 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chpf2Q3UU43 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms