Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defb33Q30KN3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 231.9 ms