Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ttc39dQ0VF76 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ttc39dQ0VF76 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ttc39dQ0VF76 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ttc39dQ0VF76 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ttc39dQ0VF76 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Ttc39dQ0VF76 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ttc39dQ0VF76 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ttc39dQ0VF76 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ttc39dQ0VF76 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ttc39dQ0VF76 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ttc39dQ0VF76 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ttc39dQ0VF76 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ttc39dQ0VF76 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc39dQ0VF76 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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