Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SctQ08535 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SctQ08535 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SctQ08535 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SctQ08535 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SctQ08535 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SctQ08535 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SctQ08535 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SctQ08535 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SctQ08535 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SctQ08535 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SctQ08535 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SctQ08535 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SctQ08535 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms