Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cnn2Q08093 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms