Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MestQ07646 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MestQ07646 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MestQ07646 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MestQ07646 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MestQ07646 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MestQ07646 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MestQ07646 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MestQ07646 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
MestQ07646 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
MestQ07646 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
MestQ07646 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
MestQ07646 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms