Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm42783-201ENSMUST00000197075 795 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Siah2Q06986 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms