Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cxcr5Q04683 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms