Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NfiaQ02780 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NfiaQ02780 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms