Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gjb5Q02739 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms