Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GscQ02591 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GscQ02591 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GscQ02591 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms