Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mc1rQ01727 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms