Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Grin2bQ01097 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Grin2bQ01097 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms