Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Apoa1Q00623 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms