Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smyd1P97443 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms