Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Arf1P84078 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Arf1P84078 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Arf1P84078 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Arf1P84078 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Arf1P84078 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Arf1P84078 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Arf1P84078 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Arf1P84078 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms