Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TgfbiP82198 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TgfbiP82198 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms