Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Irx2P81066 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Irx2P81066 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms