Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Acta2P62737 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Acta2P62737 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Acta2P62737 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms