Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn18P56857 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cldn18P56857 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn18P56857 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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