Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf5P56477 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Irf5P56477 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Irf5P56477 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Irf5P56477 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Irf5P56477 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Irf5P56477 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf5P56477 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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