Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Rad23bP54728 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad23bP54728 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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