Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Epb41l4aP52963 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms