Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Epb41P48193 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Epb41P48193 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Epb41P48193 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Epb41P48193 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Epb41P48193 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Epb41P48193 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Epb41P48193 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Epb41P48193 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Epb41P48193 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Epb41P48193 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Epb41P48193 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Epb41P48193 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Epb41P48193 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Epb41P48193 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Epb41P48193 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Epb41P48193 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Epb41P48193 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Epb41P48193 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Epb41P48193 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms