Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pik3caP42337 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms