Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TtlP38585 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtlP38585 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtlP38585 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtlP38585 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtlP38585 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtlP38585 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtlP38585 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtlP38585 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtlP38585 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtlP38585 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TtlP38585 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TtlP38585 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms