Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptk2P34152 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms