Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxc11P31313 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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