Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RxraP28700 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RxraP28700 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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