Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd12P23812 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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