Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RarbP22605 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RarbP22605 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RarbP22605 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RarbP22605 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RarbP22605 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RarbP22605 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RarbP22605 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RarbP22605 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RarbP22605 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RarbP22605 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RarbP22605 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RarbP22605 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RarbP22605 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RarbP22605 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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