Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prim1P20664 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Ifnb1-201ENSMUST00000055671 750 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prim1P20664 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms