Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
P18528 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
P18528 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms