Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
P18526 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
P18526 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms