Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DmdP11531 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DmdP11531 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
DmdP11531 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
DmdP11531 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
DmdP11531 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms