Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Becn2P0DM65 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Becn2P0DM65 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms