Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CrygdP04342 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CrygdP04342 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms