Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dnajb6O54946 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dnajb6O54946 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.6 ms