Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TsksO54887 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TsksO54887 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TsksO54887 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TsksO54887 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TsksO54887 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TsksO54887 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TsksO54887 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TsksO54887 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TsksO54887 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TsksO54887 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TsksO54887 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TsksO54887 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TsksO54887 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TsksO54887 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TsksO54887 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms