Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sdc4O35988 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sdc4O35988 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sdc4O35988 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sdc4O35988 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sdc4O35988 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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