Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Clk2O35491 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms