Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prrt1O35449 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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