Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Kcns1O35173 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms