Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2-Q1O19441 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms