Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sec22bO08547 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms