Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
BC117090L7N257 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms