Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm379J3QQ19 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Gm379J3QQ19 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gm379J3QQ19 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm379J3QQ19 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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